索邦大学成立于13世纪，由当时法国国王圣路易(Saint Louis，即路易九世)身旁之神父罗伯德·索邦(Robert de Sorbon)所创。最初是于12世纪时，在巴黎塞纳河上的西堤岛(l'Ile de la Cité)，针对当时来自法兰西、皮卡第、诺曼底与英格兰四个国家之年轻人教授神学、法律、医学及艺术四种领域。尔后于1257年在圣杰内芙耶芙(Sainte Geneviève)山丘上成立索邦学院(Le collège de Sorbonne)，因其在当时众多学院中最具知名度，规模扩大之后便以索邦大学为名。

1968年法国学生运动发动之后，巴黎大学被拆分成13座独立的大学，沿用"索邦"称谓的大学为巴黎第一大学(先贤祠-索邦大学)、巴黎第三大学(新索邦大学)和巴黎第四大学(巴黎-索邦大学)。