医科在日本属于传统学科，老牌帝国大学以及新型大学群均有开设医学院；日本医学院校都有自己的附属医院，临床训练基地资源丰富。  

日本帝国大学：东京大学、京都大学、东北大学、九州大学、北海道大学、大阪大学、名古屋大学。

旧制六大医科大学：千叶大学、金泽大学、新泻大学、冈山大学、长崎大学、熊本大学。

新制八大医科大学：东京医科齿科大学、弘前大学、群马大学、信州大学、鸟取大学、德岛大学、广岛大学、鹿儿岛大学。

国立医科大学：秋田医科大学、旭川医科大学、山形大学医学部、筑波大学医学部、滨松医科大学、滋贺医科大学、宫崎大学、富山大学、岛根大学、佐贺大学、大分大学、高知大学、福井大学、山梨大学、香川大学、琉球大学。